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商標調査で、すべての商標が調べられるのですか?

特許庁のデータベースJ-PlatPatでは、登録されている商標のほか、出願中の商標についても調べることができます。

ただ、すべての商標かと言うと、厳密にはそうではありません。
出願されたばかりの商標は、まだデータベースにそのデータが蓄積されていません。
いつの期間のデータが検索対象となるかは、文献蓄積情報で確認することができます。

しかし商標は先願主義といって、先に早く出願した方が優先して登録されますので、出願は早いに越したことがありません。それで直近の出願データは確認することができなくても、検索できる範囲の調査をしたうえで、出願をすることになります。
その意味では商標調査にも限界があります。

どうしても気になる場合には、出願を済ませてしばらくた経ってから、再度商標調査を行うことも時にあります。